Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3S4

TPK1, Thiamin pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPK1Q9H3S4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TPK1Q9H3S4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TPK1Q9H3S4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TPK1Q9H3S4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TPK1Q9H3S4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms