Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL3Q9H2J4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDCL3Q9H2J4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL3Q9H2J4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL3Q9H2J4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms