Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.326e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.836e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-209ENST00000590771 577 ntTSL 315.22■□□□□ 0.036e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.076e-10■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.526e-7■■■■■ 32.4
CSTF2TQ9H0L4 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.061e-9■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-9■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 SAP130-204ENST00000424298 849 ntTSL 211.57□□□□□ -0.561e-9■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.661e-6■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.131e-6■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 USP36-214ENST00000589225 5885 ntTSL 1 (best)13.81□□□□□ -0.21e-6■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 P2RY11-202ENST00000471843 554 ntTSL 414.62□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 32.3
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 316.68■□□□□ 0.261e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-210ENST00000491815 658 ntTSL 210.79□□□□□ -0.681e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-205ENST00000407521 513 ntTSL 410.63□□□□□ -0.711e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-211ENST00000502724 541 ntTSL 49.46□□□□□ -0.91e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-212ENST00000502727 582 ntTSL 49.38□□□□□ -0.911e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.391e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.471e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 RANBP1-213ENST00000486575 2177 ntTSL 219.54■□□□□ 0.722e-17■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.965e-9■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.522e-10■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.262e-10■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.052e-10■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PHF23-204ENST00000570899 649 ntTSL 314.72□□□□□ -0.052e-10■■■■■ 32.2
CSTF2TQ9H0L4 PRKAR1B-208ENST00000456696 518 ntTSL 515.6■□□□□ 0.094e-8■■■■■ 32.1
CSTF2TQ9H0L4 MTHFD1L-212ENST00000618312 3159 ntTSL 5 BASIC8.78□□□□□ -12e-7■■■■■ 32.1
CSTF2TQ9H0L4 ASAP2-204ENST00000484590 3869 ntTSL 27.49□□□□□ -1.219e-9■■■■■ 32.1
CSTF2TQ9H0L4 ASAP2-205ENST00000491413 497 ntTSL 47.49□□□□□ -1.219e-9■■■■■ 32.1
CSTF2TQ9H0L4 RAI1-204ENST00000489697 1570 ntTSL 314.66□□□□□ -0.065e-9■■■■■ 32.1
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-208ENST00000558856 574 ntTSL 424.05■■□□□ 1.445e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-210ENST00000559036 685 ntTSL 224.05■■□□□ 1.445e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-209ENST00000558983 847 ntTSL 323.92■■□□□ 1.425e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-212ENST00000560493 732 ntTSL 422.31■■□□□ 1.165e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.75e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.655e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.295e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-206ENST00000558049 565 ntTSL 412.39□□□□□ -0.435e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-203ENST00000449277 5182 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.085e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-201ENST00000338042 5464 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.125e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.195e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 CHFR-214ENST00000536932 584 ntTSL 414.23□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ZNF605-201ENST00000331711 838 ntTSL 214.23□□□□□ -0.137e-8■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ZNF605-205ENST00000412621 541 ntTSL 410.74□□□□□ -0.697e-8■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ZNF605-203ENST00000381215 1143 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.937e-8■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ZNF605-202ENST00000360187 9340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.127e-8■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.487e-8■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.348e-15■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.418e-15■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 SCAF4-203ENST00000434667 3846 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.838e-15■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 RPL41-204ENST00000546591 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.151e-9■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ATP13A3-205ENST00000457986 490 ntTSL 323.32■■□□□ 1.323e-7■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.793e-7■■■■■ 32
CSTF2TQ9H0L4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.65e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.373e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.093e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.315e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 PPP4R3B-203ENST00000611717 5243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.45e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 PPP4R3B-206ENST00000616407 4385 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.485e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 AGFG1-203ENST00000409171 1783 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 PPP4R3B-204ENST00000612688 2981 ntTSL 211.13□□□□□ -0.635e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 PPP4R3B-201ENST00000470801 597 ntTSL 45.85□□□□□ -1.475e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.965e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 ZNF280C-202ENST00000447817 1970 ntTSL 1 (best)2.27□□□□□ -2.055e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 AC022167.2-201ENST00000565934 2288 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.649e-9■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-208ENST00000623810 781 ntTSL 516.67■□□□□ 0.264e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-209ENST00000624714 807 ntTSL 215.73■□□□□ 0.114e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.194e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-206ENST00000624748 684 ntTSL 313.69□□□□□ -0.224e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 FP565260.6-207ENST00000624648 696 ntTSL 211.42□□□□□ -0.584e-10■■■■■ 31.9
CSTF2TQ9H0L4 MYL12A-208ENST00000580353 565 ntTSL 214.72□□□□□ -0.052e-25■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 MYL12A-207ENST00000579226 947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.722e-25■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 MYL12A-206ENST00000578611 1004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.752e-25■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 MYL12A-210ENST00000583449 334 ntTSL 29.84□□□□□ -0.832e-25■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 MYL12A-201ENST00000217652 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.932e-25■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-206ENST00000454469 2087 ntTSL 217.15■□□□□ 0.342e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-217ENST00000524396 2206 ntTSL 514.23□□□□□ -0.132e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-211ENST00000478380 1395 ntTSL 1 (best)9.82□□□□□ -0.842e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 TNS1-217ENST00000490566 1652 ntTSL 29.28□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-214ENST00000487230 537 ntTSL 48.91□□□□□ -0.982e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-203ENST00000382341 1873 ntTSL 28.85□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-209ENST00000469391 6386 ntTSL 1 (best) BASIC8.66□□□□□ -1.022e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-205ENST00000453981 7237 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.032e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.142e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-213ENST00000483757 4788 ntTSL 1 (best)7.87□□□□□ -1.152e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 DOCK8-216ENST00000495184 9277 ntTSL 1 (best)7.53□□□□□ -1.22e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.296e-9■■■■■ 31.8
CSTF2TQ9H0L4 ZZZ3-203ENST00000414381 561 ntTSL 419.14■□□□□ 0.652e-8■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 ZZZ3-206ENST00000463166 587 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.115e-21■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 RPS24-209ENST00000476545 815 ntTSL 312.29□□□□□ -0.445e-21■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 RPS24-204ENST00000440692 2814 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.55e-21■■■■■ 31.7
CSTF2TQ9H0L4 RPS24-206ENST00000465692 778 ntTSL 29.81□□□□□ -0.845e-21■■■■■ 31.7
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