Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NBPF3Q9H094 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NBPF3Q9H094 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
NBPF3Q9H094 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
NBPF3Q9H094 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
NBPF3Q9H094 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms