Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TMEM39BQ9GZU3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TMEM39BQ9GZU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
TMEM39BQ9GZU3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TMEM39BQ9GZU3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
TMEM39BQ9GZU3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TMEM39BQ9GZU3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMEM39BQ9GZU3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMEM39BQ9GZU3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMEM39BQ9GZU3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TMEM39BQ9GZU3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms