Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZC3H12CQ9C0D7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZC3H12CQ9C0D7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
ZC3H12CQ9C0D7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZC3H12CQ9C0D7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZC3H12CQ9C0D7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms