Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D3

ZYG11B, Protein zyg-11 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZYG11BQ9C0D3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ZYG11BQ9C0D3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZYG11BQ9C0D3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZYG11BQ9C0D3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZYG11BQ9C0D3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms