Protein–RNA interactions for Protein: Q9C002

NMES1, Normal mucosa of esophagus-specific gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMES1Q9C002 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NMES1Q9C002 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NMES1Q9C002 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NMES1Q9C002 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
NMES1Q9C002 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
NMES1Q9C002 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms