Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
GTPBP4Q9BZE4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GTPBP4Q9BZE4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
GTPBP4Q9BZE4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GTPBP4Q9BZE4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GTPBP4Q9BZE4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms