Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE3

BARHL1, BarH-like 1 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL1Q9BZE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BARHL1Q9BZE3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BARHL1Q9BZE3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BARHL1Q9BZE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BARHL1Q9BZE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms