Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ1

C1QTNF1, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF1Q9BXJ1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
C1QTNF1Q9BXJ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
C1QTNF1Q9BXJ1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
C1QTNF1Q9BXJ1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
C1QTNF1Q9BXJ1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms