Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWG6

SCNM1, Sodium channel modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNM1Q9BWG6 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SCNM1Q9BWG6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCNM1Q9BWG6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCNM1Q9BWG6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCNM1Q9BWG6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1007.8 ms