Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PBDC1Q9BVG4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PBDC1Q9BVG4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PBDC1Q9BVG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PBDC1Q9BVG4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms