Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
VAMP8Q9BV40 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VAMP8Q9BV40 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VAMP8Q9BV40 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VAMP8Q9BV40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms