Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT81

SOX7, Transcription factor SOX-7, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX7Q9BT81 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOX7Q9BT81 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOX7Q9BT81 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOX7Q9BT81 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX7Q9BT81 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142 ms