Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TMEM79Q9BSE2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TMEM79Q9BSE2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM79Q9BSE2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEM79Q9BSE2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM79Q9BSE2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms