Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22CQ9BRL7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SEC22CQ9BRL7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SEC22CQ9BRL7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SEC22CQ9BRL7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SEC22CQ9BRL7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms