Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR77

CCDC77, Coiled-coil domain-containing protein 77, humanhuman

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC77Q9BR77 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC77Q9BR77 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC77Q9BR77 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC77Q9BR77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC77Q9BR77 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC77Q9BR77 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms