Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SGIP1Q9BQI5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SGIP1Q9BQI5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SGIP1Q9BQI5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SGIP1Q9BQI5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SGIP1Q9BQI5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms