Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQG1

SYT3, Synaptotagmin-3, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT3Q9BQG1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYT3Q9BQG1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYT3Q9BQG1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYT3Q9BQG1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYT3Q9BQG1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms