Protein–RNA interactions for Protein: Q99727

TIMP4, Metalloproteinase inhibitor 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMP4Q99727 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TIMP4Q99727 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TIMP4Q99727 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TIMP4Q99727 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms