Protein–RNA interactions for Protein: Q99633

PRPF18, Pre-mRNA-splicing factor 18, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF18Q99633 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF18Q99633 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF18Q99633 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PRPF18Q99633 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRPF18Q99633 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms