Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PFDN5Q99471 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PFDN5Q99471 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PFDN5Q99471 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms