Protein–RNA interactions for Protein: Q96RE7

NACC1, Nucleus accumbens-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACC1Q96RE7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NACC1Q96RE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NACC1Q96RE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
NACC1Q96RE7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NACC1Q96RE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NACC1Q96RE7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NACC1Q96RE7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NACC1Q96RE7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NACC1Q96RE7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NACC1Q96RE7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NACC1Q96RE7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms