Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ARXQ96QS3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.81■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
ARXQ96QS3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC32.75■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
ARXQ96QS3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
ARXQ96QS3 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ARXQ96QS3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ARXQ96QS3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms