Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q40

CDK15, Cyclin-dependent kinase 15, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK15Q96Q40 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CDK15Q96Q40 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CDK15Q96Q40 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CDK15Q96Q40 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CDK15Q96Q40 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms