Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GBP4Q96PP9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
GBP4Q96PP9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GBP4Q96PP9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GBP4Q96PP9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GBP4Q96PP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.8 ms