Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB2

SFXN2, Sideroflexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN2Q96NB2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SFXN2Q96NB2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SFXN2Q96NB2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SFXN2Q96NB2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SFXN2Q96NB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms