Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
YTHDC1Q96MU7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
YTHDC1Q96MU7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
YTHDC1Q96MU7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
YTHDC1Q96MU7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
YTHDC1Q96MU7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms