Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NSMCE2Q96MF7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSMCE2Q96MF7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSMCE2Q96MF7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NSMCE2Q96MF7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NSMCE2Q96MF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms