Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SGSM3Q96HU1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SGSM3Q96HU1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SGSM3Q96HU1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SGSM3Q96HU1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms