Protein–RNA interactions for Protein: Q96ET8

TVP23C, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog C, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23CQ96ET8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TVP23CQ96ET8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TVP23CQ96ET8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TVP23CQ96ET8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TVP23CQ96ET8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms