Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FBXO17Q96EF6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
FBXO17Q96EF6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
FBXO17Q96EF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FBXO17Q96EF6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 181.7 ms