Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT3

CENPT, Centromere protein T, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPTQ96BT3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CENPTQ96BT3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CENPTQ96BT3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CENPTQ96BT3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CENPTQ96BT3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms