Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EME1Q96AY2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EME1Q96AY2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EME1Q96AY2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EME1Q96AY2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
EME1Q96AY2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.4 ms