Protein–RNA interactions for Protein: Q96A28

SLAMF9, SLAM family member 9, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF9Q96A28 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLAMF9Q96A28 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLAMF9Q96A28 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLAMF9Q96A28 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLAMF9Q96A28 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms