Protein–RNA interactions for Protein: Q969H8

MYDGF, Myeloid-derived growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYDGFQ969H8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
MYDGFQ969H8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MYDGFQ969H8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MYDGFQ969H8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MYDGFQ969H8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms