Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMARCE1Q969G3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMARCE1Q969G3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMARCE1Q969G3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms