Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HGDQ93099 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HGDQ93099 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HGDQ93099 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HGDQ93099 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGDQ93099 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGDQ93099 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGDQ93099 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HGDQ93099 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HGDQ93099 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HGDQ93099 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGDQ93099 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGDQ93099 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGDQ93099 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGDQ93099 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HGDQ93099 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGDQ93099 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGDQ93099 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HGDQ93099 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HGDQ93099 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HGDQ93099 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HGDQ93099 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HGDQ93099 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HGDQ93099 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HGDQ93099 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HGDQ93099 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HGDQ93099 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HGDQ93099 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HGDQ93099 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HGDQ93099 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HGDQ93099 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HGDQ93099 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HGDQ93099 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HGDQ93099 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HGDQ93099 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HGDQ93099 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HGDQ93099 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HGDQ93099 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGDQ93099 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGDQ93099 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HGDQ93099 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HGDQ93099 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HGDQ93099 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGDQ93099 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGDQ93099 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGDQ93099 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGDQ93099 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HGDQ93099 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGDQ93099 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGDQ93099 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGDQ93099 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGDQ93099 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HGDQ93099 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HGDQ93099 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HGDQ93099 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGDQ93099 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HGDQ93099 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms