Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
AP3S1Q92572 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AP3S1Q92572 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
AP3S1Q92572 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
AP3S1Q92572 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AP3S1Q92572 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms