Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDU5

VN1R17P, Putative vomeronasal receptor-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R17PQ8TDU5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
VN1R17PQ8TDU5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
VN1R17PQ8TDU5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
VN1R17PQ8TDU5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms