Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB73

NDNF, Protein NDNF, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNFQ8TB73 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDNFQ8TB73 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDNFQ8TB73 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NDNFQ8TB73 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NDNFQ8TB73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NDNFQ8TB73 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms