Protein–RNA interactions for Protein: Q8TA86

RP9, Retinitis pigmentosa 9 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9Q8TA86 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RP9Q8TA86 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RP9Q8TA86 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RP9Q8TA86 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RP9Q8TA86 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RP9Q8TA86 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms