Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG31

KNL1, Kinetochore scaffold 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNL1Q8NG31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KNL1Q8NG31 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KNL1Q8NG31 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KNL1Q8NG31 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KNL1Q8NG31 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KNL1Q8NG31 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms