Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC148Q8NFR7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC148Q8NFR7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC148Q8NFR7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC148Q8NFR7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC148Q8NFR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms