Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFD5

ARID1B, AT-rich interactive domain-containing protein 1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1BQ8NFD5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARID1BQ8NFD5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ARID1BQ8NFD5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID1BQ8NFD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID1BQ8NFD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms