Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEV1

CSNK2A3, Casein kinase II subunit alpha 3, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A3Q8NEV1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSNK2A3Q8NEV1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CSNK2A3Q8NEV1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CSNK2A3Q8NEV1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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