Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPFIBP2Q8ND30 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PPFIBP2Q8ND30 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIBP2Q8ND30 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIBP2Q8ND30 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms