Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DTX3Q8N9I9 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
DTX3Q8N9I9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
DTX3Q8N9I9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DTX3Q8N9I9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DTX3Q8N9I9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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