Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDCL2Q8N4E4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDCL2Q8N4E4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PDCL2Q8N4E4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PDCL2Q8N4E4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PDCL2Q8N4E4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PDCL2Q8N4E4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms